鼓楼医疗保障局于2018年12月成立，为福州市医疗保障局在鼓楼的派出机构，负责辖区内医疗保障工作。
(一)贯彻执行国家和省有关医疗保险、生育保险、医疗救助等医疗保障制度的法律法规和政策。
(二)负责辖区医疗保障基金决算工作，监督医疗保障基金收支、管理和运营。监督管理辖区纳入医保范围内的医疗服务行为、医疗费用，依法查处医疗保障领域违法违规行为。
（三）实施医疗服务项目、医疗服务设施收费等政策。推动建立市场主导的社会医药服务价格形成机制。
（四）组织实施医疗保障定点医药机构协议和支付管理办法，指导医疗保障定点医药机构管理；建立健全医疗保障信用评价体系和信息披露制度。
（五）落实异地就医管理和费用结算政策，执行全国医保异地就医即时结算政策和费用审核、结算工作；建立健全医疗保障关系转移接续制度。
（六）承担辖区基本医疗保险、生育保险、医疗救助等医疗保障管理各项工作。
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